Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpraQ9DBG7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms