Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TrmuQ9DAT5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TrmuQ9DAT5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TrmuQ9DAT5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TrmuQ9DAT5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TrmuQ9DAT5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TrmuQ9DAT5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TrmuQ9DAT5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrmuQ9DAT5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms