Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms