Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DA42 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9DA42 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9DA42 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9DA42 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9DA42 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms