Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph9Q9D9V4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms