Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms