Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q9D9H8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D9H8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D9H8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D9H8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D9H8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D9H8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D9H8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D9H8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D9H8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D9H8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D9H8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms