Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmco5aQ9D9D5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms