Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot8Q9D8X5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms