Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms