Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erp27Q9D8U3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms