Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tvp23bQ9D8T4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms