Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms