Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms