Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4bQ9D8B3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms