Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms