Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms