Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P7

Clic3, Chloride intracellular channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic3Q9D7P7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Clic3Q9D7P7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Clic3Q9D7P7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Clic3Q9D7P7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Clic3Q9D7P7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clic3Q9D7P7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clic3Q9D7P7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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