Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nop56Q9D6Z1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nop56Q9D6Z1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nop56Q9D6Z1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Nop56Q9D6Z1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Nop56Q9D6Z1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms