Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms