Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms