Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necab3Q9D6J4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms