Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms