Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt34Q9D646 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms