Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms