Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms