Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zc2hc1bQ9D534 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms