Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms