Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms