Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms