Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms