Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Creb3l4Q9D2A5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Creb3l4Q9D2A5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Creb3l4Q9D2A5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Creb3l4Q9D2A5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Creb3l4Q9D2A5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Creb3l4Q9D2A5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Creb3l4Q9D2A5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Creb3l4Q9D2A5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Creb3l4Q9D2A5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Creb3l4Q9D2A5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Creb3l4Q9D2A5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms