Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krtap5-3Q9D226 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms