Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chordc1Q9D1P4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chordc1Q9D1P4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms