Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms