Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syf2Q9D198 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms