Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms