Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ift27Q9D0P8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ift27Q9D0P8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ift27Q9D0P8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ift27Q9D0P8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ift27Q9D0P8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ift27Q9D0P8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ift27Q9D0P8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ift27Q9D0P8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ift27Q9D0P8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ift27Q9D0P8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ift27Q9D0P8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift27Q9D0P8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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