Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zbed3Q9D0L1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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