Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rfc5Q9D0F6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rfc5Q9D0F6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rfc5Q9D0F6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rfc5Q9D0F6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rfc5Q9D0F6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rfc5Q9D0F6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms