Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mms19Q9D071 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms