Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms