Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms