Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snf8Q9CZ28 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms