Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdhd3Q9CYW4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms