Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Prdm5Q9CXE0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Prdm5Q9CXE0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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