Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Mgme1Q9CXC3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mgme1Q9CXC3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mgme1Q9CXC3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mgme1Q9CXC3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mgme1Q9CXC3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mgme1Q9CXC3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mgme1Q9CXC3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mgme1Q9CXC3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mgme1Q9CXC3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mgme1Q9CXC3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mgme1Q9CXC3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mgme1Q9CXC3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mgme1Q9CXC3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mgme1Q9CXC3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms