Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms