Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CWU4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms