Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms